Hrvatski muzej medicine i farmacije, specijalizirani muzej hrvatske medicinske i farmaceutske baštine, osnovan 2014. u Zagrebu kao dio Hrvatske akademije znanosti i umjetnosti.
Muzej je nastao na poticaj Stelle Fatović-Ferenčić, upraviteljice Odsjeka za povijest medicinskih znanosti HAZU-a, koji već pedesetak godina čuva Zbirku za povijest medicine i farmacije. Zbirka je nastala 1960-ih u Zagrebu objedinjavanjem predmeta Muzeja za povijest zdravstva u Hrvatskoj, osnovanoga 1944., i Instituta za povijest farmacije. Činilo ju je oko 3500 predmeta koji su se sakupljali od 1930-ih: predmeti iz medicinske tehnike, farmaceutske industrijske baštine, ljekarnička oprema i dokumentarna građa. Uz preuzetu građu Zbirke, u nacionalnom, europskom i svjetskom kontekstu Muzej predstavlja i oko 6000 knjiga, mnoštvo fotografija, ostavštinu Hrvatskoga farmaceutskog društva (1946), kao i medicinsku ostavštinu obitelji poznatih hrvatskih liječnika, poput Franje Dursta, Sergija Dogana i Theodora Dürrigla. Neke od muzejskih zbirki su Otorinolaringološka zbirka, Stomatološka zbirka, Zbirka ambalaže i propagande farmaceutskih proizvoda, Zbirka ljekarničke opreme, namještaja i utenzilija, Zbirka medicinske opreme, instrumenata i pomagala te Zbirka tvornice lijekova Kaštel. Voditelj Muzeja je akademik Marko Pećina.
S. Fatović-Ferenčić: Od zbirke do Hrvatskog muzeja medicine i farmacije: povijest nastojanja vezanih uz realizaciju muzeja. Liječničke novine, 141(2015) 7–15, str. 70–73.
S. Brkić Midžić: Novi muzej u sastavu Hrvatske akademije znanosti i umjetnosti – Hrvatski muzej medicine i farmacije. Glasnik HAZU, 2(2016) 3–4, str. 42–45.